基于小波分析的蛋白质序列分形研究

利用氨基酸的疏水自由能对蛋白质序列进行编码,选择墨西哥帽小波对于编码序列进行多尺度分解,应用基于小波分解的Abry-Veitch算法来研究蛋白质一级结构的分形特性,最后通过计算Hurst指数来定量刻画蛋白质序列的自相似性。实验结果表明,本文的方法只依据蛋白质一级序列的信息,可获得反映了蛋白质序列排列的自相似性和复杂度一个判据,相比于其他方法,本文的方法简单、可靠,为蛋白质序列的分析和研究提供了一个新的思路。