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麻风病全基因组关联分析 被引量:4

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摘要 背景:由于麻风分枝杆菌宿主的局限性和难以在体外培养,限制了对麻风病的研究及其生物学方面的了解。宿主的遗传因素不仅影响对麻风菌的易感性,也影响麻风病的病程。方法:采用Illumina Human 610-Quad BeadChips对706个麻风病例及1225名正常对照人群进行全基因组扫描,扫描的结果采用PLINK软件进行统计学分析。根据分析结果对可能阳性的93个SNPs位点在3254个麻风病例及5955名正常对照中验证,以确定麻风病的易感基因。同时我们在麻风病的不同临床型别中进行了异质性检验,以期发现与型别相关的易感基因。结果:(1)研究发现位于6个区域的15个SNPs达到了全基因关联研究水平(P<1.0×10^(-8)),定位了6个麻风病的易感基因:HLA-DR,RIPK2,TNFSF15,CCDC122,C13ORF31和NOD2。另外LRRK2基因对应SNP的P值为5.10×10,提示该基因可能为麻风病的易感基因。(2)研究发现5个SNPs在多菌型麻风病中的遗传效力强于少菌型。结论:位于调节固有免疫NOD2介导的信号通路中基因的变异与麻风病的易感性相关。
出处 《中国麻风皮肤病杂志》 2010年第1期1-4,共4页 China Journal of Leprosy and Skin Diseases
基金 山东省皮肤病性病防治研究所 山东省医学科学院专项资金 山东省麻风防治专项资金 山东省科技攻关计划(2006GG2302029) 山东省卫生系统1020人才专项资金 山东省泰山学者专项资金 国家自然科学基金(30771943/C030116) 安徽省省长基金(2007-7)的资助
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引证文献4

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