摘要
miRNAs是新发现的一类长约21个碱基对的非编码RNAs.它们在转录后基因调控中起着重要作用.它们的靶目标涉及许多生物进程,如发育、新陈代谢、胁迫应答等.尽管已经有大量物种的miRNAs报道,然而关于高粱miRNAs的相关报道却十分有限.本研究通过基于基因组勘测序列(GSS)的同源序列搜索和miRNAs的二级结构分析,总共发现17条新的miRNAs.它们不均等的分布于11个miRNAs家族中.一些miRNAs的基因存在多位点并且不仅仅存在于单一基因位点上.大多数miRNAs存在同一生物界的保守性,但是我们发现,高粱sbi-miR127和sbi-miR466分别表现出与人类(H.sapiens)和家鼠(M.musculus)具有高度序列相似性.通过靶基因预测软件MiRU对miRNAs的分析表明,它们可能调节64种靶基因,其中多数涉及RNA加工、新陈代谢、细胞周期、蛋白质降解、胁迫应答及转录.在11个miRNAs家族中至少有7个miRNAs的靶目标是NADPH-细胞色素p450还原酶、核苷二磷酸激酶、超氧化物歧化酶等一些在新陈代谢和胁迫应答中必要的蛋白,说明miRNAs在这些过程中起着十分重要的作用.
出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第7期553-561,共9页
Chinese Science Bulletin
基金
国家自然科学基金(批准号:30600384)资助项目
