水稻黄矮弹状病毒的leader区和trailer区的序列分析及其体内转录物的鉴定

克隆及测定了水稻黄矮病毒基因组RNA的 3′端leader区和 5′端trailer区的序列 .结果表明 ,RYSV的 3′leader长 2 0 3个核苷酸 ,5′trailer长 191个核苷酸 .两者末端的 9个核苷酸完全互补 ,可形成弹状病毒基因组RNA的典型的锅柄结构 .与其他弹状病毒的leader和trailer相比较 ,RYSV的leader和trailer较长 ,除leader的 3′末端和trailer的 5′末端序列具有一定的保守性外 ,其余的核苷酸序列无明显的同源性 .用 3′RACE方法在感染RYSV的水稻中检测出leader的转录物 ,并证明该leaderRNA具有polyA尾巴 .这是继苦苣菜黄脉病毒的leaderRNA后第 2例弹状病毒leaderRNA带polyA尾巴的报道 .用类似的方法没有检测到带polyA尾巴的trailer的正链转录物 .