摘要
为建立余甘子SRAP-PCR反应的最优体系,通过正交设计和单因素试验调整优化PCR反应各因素(模板DNA、Mg^(2+)、dNTPs、引物)。结果表明,各因素对扩增结果均有不同的影响。采用50ng模板DNA,2.0mmol/L Mg^(2+),0.4 mmol/L dNTPs,0.2 μmol/L引物的20μL反应体系可扩增出最清晰丰富的多样性条带。使用该优化体系检测12份余甘子种质资源样品,结果稳定可信,适用于分子遗传学研究。
The optimized SRAP-PCR amplification system for Phyllanthus emblica was established by the orthogonal design and single factor optimization of PCR factor(template DNA,Mg^2 +,dNTPs,primers).It revealed that each PCR factor had different effect on the PCR results,and 50 ng template DNA,2.0 mmol/L Mg^ 2 +,0.4 mmol/L dNTPs,0.2 μ mol/L primers in a total of 20 μ L reaction solution amplified the most rich polymorphism and clear bands.The optimized SRAP-PCR system was tested on twelve Phyllanthus emblica germplasms and proved to be steady and reliable for molecular genetics research.
出处
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2010年第16期26-30,共5页
Chinese Agricultural Science Bulletin
基金
国家科技基础条件平台项目"热带作物余甘子种质资源多样性图谱"(2005DKA2100)
国家948项目"境外热带作物种质资源引进"(2010-G2-13)
国家科技支撑计划项目"台湾果树新品种与品质控制新技术引进创新研究"(2007BAD07B01)
福建省科技计划重点项目"珍稀果树余甘子种质资源鉴定及良种筛选研究"(2007N0028)
福建省农科院青年科技人才创新基金"余甘子RAPD指纹图谱的建立与SCAR标记的开发"(2008QA-5)
关键词
余甘子
SRAP
优化
Phyllanthus emblica
SRAP
optimization