期刊文献+

晚期肺腺癌危重患者预警蛋白质指纹由阴性向阳性漂移的分析

Analysis of lost goodwill target proteomic fingerprints drifting from negative to positive in advanced lung adenocarcinoma patients
原文传递
导出
摘要 目的分析晚期肺腺癌危重患者预警蛋白质(LGT)指纹由阴性向阳性漂移时是否出现有意义的差异指纹。方法应用表面增强激光解析/电离-飞行时间质谱(SELDI—TOF—MS)、CMIO蛋白质芯片技术检测31例晚期肺腺癌患者LGT指纹由阴性向阳性漂移前后的血清样本的蛋白质指纹谱,以质/荷(M/Z)为11000~12000+H时出现丰度〉10%峰簇视为LGT阳性,反之为阴性。采用Biomarker Wizard3.1、BiomarkerPattern软件筛选差异指纹,建立相应的决策树模型。结果晚期肺腺癌患者LGT指纹由阴性向阳性漂移时,有16个蛋白质指纹差异有统计学意义(P〈0.05),其中上调指纹10个,其M/Z:11531、11483、11686、11394、11822、11323、11911、12450、5811和5709,下调指纹6个,其M/Z:4126、13927、13784、7001、1959和2741。结论SELDI—TOF—MS、CMl0蛋白质芯片技术检测晚期肺腺癌患者血清捕获的M/z为11531、11483、11686、11394、11822、11323的蛋白质指纹上调可视为晚期肺腺癌患者LGT指纹由阴性向阳性漂移时LGT蛋白质指纹亚型(丰度〉10%);M/Z为11911、12450、5811和5709的蛋白质指纹上调,M/Z为4126、13927、13784、7001、1959和2741的蛋白质指纹下调,可视为晚期肺腺癌患者LGT指纹由阴性向阳性漂移时伴随的相关蛋白质组指纹(丰度≤10%)。上述模型构成LGT蛋白质指纹由阴性向阳性漂移时的指纹库,将为进一步研究该指纹表达的蛋白质提供研究的切入点。 Objective To analyze the serum related proteomic fingerprints when Lost Goodwill Target (LGT) proteomic fingerprints drifting from negative to positive in the advanced lung adenocarcinoma patients. Methods The serum proteomic fingerprints of 31 advanced lung adenocarcinoma patients whose LGT fingerprints drifted from negative to positive were detected by SELDI and CM10 protein chip. More than 10 % cluster and M/Z values from 11,000+H to 12,000+H was regarded as LGT positive, otherwise as negative. Different fingerprints were screened by Biomarker Wizard 3.1 and Biomarker Wizard software and the decision tree model was established. Results There were 16 statistically different protein peaks when LGT fingerprints drifting from negative to positive, including 10 up-regulation proteomic fingerprints (M/Z : 11531, 11483, 11686, 11394, 11822, 11323, 11911, 12450, 5811 and 5709) and 6 down regulation proteomic fingerprints( M/Z: 4126, 13927, 13784, 7001, 1959 and 2741). Conclusion By SELDI and CM10 protein chip detection, up-regulating fingerprints of M/Z 11531, 11483, 11686, 11394, 11822 and 11323 were regarded as the subtype of LGT when it drifting from negative to positive, while up-regulation of M/Z 1191 l, 12450, 5811 and 5709 and down-regulating of M/Z 4126, 13927, 13784, 7001 and 1959 were regarded as the related fingerprints when LGT drifting from negative to positive. The above different fingerprints are constituted of the fingerprints library when LGT fingerprints drifting from negative to positive and it will provide a platform for studying the LGT proteins.
出处 《肿瘤研究与临床》 CAS 2010年第9期607-609,共3页 Cancer Research and Clinic
关键词 肺肿瘤 腺癌 光谱法 质量 基质辅助激光解吸电离 蛋白质组学 肽谱 Lung neoplasms Adenocarcinoma Spectrometry, mass, matrix-assisted laser desorptim-ionization Proteomics Peptide maping
  • 相关文献

参考文献9

二级参考文献10

  • 1裴毅,郭素堂,王清馨,米振国,赵嘉训,刘维兰,王蓉,韩琳,马小军,古晓东,姚壁,纪丕军,杨永明,魏淑青.一组新发现的肿瘤功能性蛋白质组的指纹图谱[J].肿瘤研究与临床,2005,17(3):153-155. 被引量:16
  • 2裴毅,郭素堂,王清馨,米振国,赵嘉训,刘维兰,王蓉,韩琳,马小军,古晓东,姚壁,纪丕军,杨永明,魏淑青.LGT蛋白质组对肿瘤患者临床意义的首次观察[J].肿瘤研究与临床,2005,17(3):156-158. 被引量:19
  • 3艾利弗洛斯 戴尔蒙德.早期癌症诊断的血清蛋白质组模型分析:应该注意的潜在问题.国家肿瘤学杂志,2004,96(5):353-356.
  • 4裴毅.标记恶性肿瘤预后的预警蛋白质组指纹特征的发现及认定.山西省科学技术厅.晋科鉴字[2005]第193号.2005,11.
  • 5CONRADS TP, FUSARO VA, ROSS S, et al. Proteomic patterns as a diagnostic tool for early-stage cancer: a review of its progress to a clinically relevant tool [J], Mol Diagn, 2004,8 (2):77-85
  • 6裴毅.标记恶性肿瘤预后的预警蛋白质组指纹特征的发现及认定.山西省科学技术厅.晋科鉴字[2005]第193号
  • 7江苏新医学院.中药大辞典[M]上海:上海科学技术出版社,20009-12.
  • 8陈奇.中药药理研究方法[M]北京:人民卫生出版社,1996.
  • 9谢莉,马小军,魏淑青,李琦,李波,裴毅.用SELDI技术预测吉非替尼治疗肺癌疗效的前瞻性研究报告[J].现代生物医学进展,2008,8(8):1498-1500. 被引量:18
  • 10肖雪媛,卫秀平,何大澄.应用蛋白质芯片技术从血清中筛选肺癌标志蛋白[J].中国科学(C辑),2003,33(4):323-328. 被引量:51

共引文献15

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部