期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息

遗传算法在RNA二级结构预测中的应用 被引量：1

Application of Genetic Algorithm in the Prediction of RNA Secondary Structure
下载PDF
导出
摘要 介绍了几类遗传算法在RNA二级结构预测中的应用,并探讨该领域进一步的研究方向。 The application of several kinds of genetic algorithm in the prediction of the secondary structure of RNA was introduced. The direction of the further research in this field was also explored.
作者 曹素兵 朱婵
机构地区 四川工程职业技术学院 四川建筑职业技术学院
出处 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第24期12933-12934,共2页 Journal of Anhui Agricultural Sciences
关键词 RNA二级结构 遗传算法 自由能 茎区 RNA secondary structure Genetic algorithm Free energy Stem
分类号 Q522 [生物学—生物化学]
  • 相关文献

参考文献7

  • 1SHAPIRO B A,WU J C,DAVID BENGALI,et al.The massively parallel genetic algorithm for RNA folding MIMD implementation and population variation[J].Bioinformatics,2001,17(2):137-148.
  • 2Van BATENBURG F H D,GULTYAEV A P,PLEIJ C W A.An APL_programmed genetic algorithm for the prediction of RNA secondary structure[J].Journal of Theoreti Biology,1995,174(3):269-280.
  • 3WIESE K C,DESCHENES A A,HENDRIKS A G.RnaPredict-an evolutionary algorithm for RNA secondary structure prediction[J].IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics,2008,5(1):25-41.
  • 4任清华,莫忠息,陶玉敏.预测RNA二级结构的一种遗传模拟退火算法[J].武汉大学学报（理学版）,2004,50(1):23-28. 被引量：7
  • 5邹权,郭茂祖,张涛涛.RNA二级结构预测方法综述[J].电子学报,2008,36(2):331-337. 被引量：24
  • 6SHAPIRO B A,WU J C.Predicting RNA H-type pseudoknots with the massively parallel gengtic algorithm[J].CABIOS,1997,13(4):459-471.
  • 7WIESE K C,GLEN E.A permutation-based genetic algorithm for the RNA folding problem:a critical look at selection strategies,crossover operators and representation issues[J].Biosystems,2003,72(1/2):29-41.

二级参考文献43

  • 1李伍举,吴加金.基于螺旋区随机堆积的RNA二级结构预测[J].生物物理学报,1996,12(2):213-218. 被引量：15
  • 2Tao Jiang, Ying Xu, Michael Q. Zhang. Current Topics in Computational Molecular Biology[M].北京:清华大学出版社,2002.
  • 3Furtig B, Richter C, Wohncrt J, Schwalbe H: NMR spectroscopy of RNA[J]. Chembiochem, 2003,4(10) :936 - 962.
  • 4E Ten Dam, K Pleij, D Draper. Structural and functional aspects of RNA pseudoknots[ J] .Biochemistry, 1992,31(47) : 11665 - 11676.
  • 5JE Tabaska,RB Cary,HN Gabow, GD Stormo. An RNA folding method capable of identifying pseudoknots and base triples [J]. Bioinformatics, 1998,14(8) :691 - 699.
  • 6Xiaolu Huang, He.sham Ali. High sensitivity RNA pseudoknot prediction[J]. Nucleic Acids Research, 2007, 35 ( 2 ) : 656 - 663.
  • 7David P Giedroc, Carla A Theimer, Paul L Nixon. Stucture, stability and function of RNA pseudoknots involved in stimulating ribosomal frameshifting[J] .Journal of Molecular Biology, 2000,298(2) : 167 - 185.
  • 8Tinoco I,Uhlenbeck O C,Levine M D. Estimation of secondary structure in ribonucleic acids [J]. Nature, 1971,230(5293) : 362 - 367.
  • 9J A Jaeger,D H Turner,M Zuker. Improved predictions of secondary structures for RNA[ J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 1989,86(20) :7706- 7710.
  • 10David H Mathews, Jeffret Sabina, Michael Zuker, Douglas H Turner. Expand sequence dependence of thermodynamic parameterrs improves prediction of RNA secondary structure[ J ]. Journal of Molecular Biology, 1999,288(5) : 911 - 940.

共引文献26

同被引文献5

引证文献1

安徽农业科学
2010年 第24期

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部