摘要
为解决经典分水岭算法的过分割问题,提出了一种基于标记分水岭的蛋白点检测算法。该算法首先对凝胶电泳图像进行预处理去除噪声、背景和条纹,然后在形态梯度图像上利用峰值法找出分水岭的内部标记,最后采用经典的分水岭方法检测出蛋白点,避免了蛋白点过分割现象。通过凝胶电泳图像的验证实验,结果表明本文算法的有效性。
To solve the over-segmentation problem of classical watershed algorithm,this paper proposes a marker-controlled watershed algorithm for protein spots detection. The proposed algorithm first applies image processing technology to eliminate noise,remove streak and correct background,then utilizes peak-value method to find inner mark of watershed,at last adopts classical watershed algorithm to detect spots. Accordingly it can avoid over-segmentation. The experimental results of 2D-gel electrophoresis image show that this new algorithm is effective.
出处
《微计算机信息》
2010年第31期115-117,共3页
Control & Automation
基金
基金申请人:熊邦书
项目名称:基于图像的高精度测量方法与测量系统研究
基金颁发部门:江西省教育厅(GJJ09183)
基金申请人:熊邦书
项目名称:高精度图像测量的关键技术研究
基金颁发部门:江西省自然科学基金委员会(2008GZS0032)
关键词
凝胶电泳
蛋白点
分水岭
过分割
2D-gel electrophoresis
protein spots
watershed
over-segmentation