龙眼rbcL基因结构分析

The Analysis of rbcL Gene Structure in Longan( Dimocarpus longan Lour.)

通过Ｓｏｕｔｈｅｒｎ 杂交等分析， 分离和克隆了龙眼叶绿体ＤＮＡＬ１４５ 片段， 其中含大部分ｒｂｃＬ 基因。通过酶切分析制物理图谱， 结合亚克隆和ＰＣＲ扩增， 测序分析了龙眼ｒｂｃＬ基因全序列１ ８３６ ｂｐ ， 其中基因编码区为１ ４２８ ｂｐ， 编码４７５ 个氨基酸和一个终止密码子， ｒｂｃＬ基因的５’上游区长２８４ ｂｐ ， 在基因上游区－ １９１ ～－ ２２０ ｂｐ 范围内有推测的类似原核生物的启动子序列： － １０ 区的ＴＡＣＡＡＴ， － ３５ 区的ＴＴＧＣＧＣ。在距离第一个转译起始密码子ＡＴＧ 上游－６～－ １０ ｂｐ 处， 有核糖体结合位点ＧＧＡＧＧ， 类似于原核生物中的ＳＤ 序列。５’前导区１８５ ｂｐ。基因的３’下游区长１２４ ｂｐ， 在距离转译终止密码子ＴＡＡ 下游３０ ～１００ ｂｐ 处， 有３ 个转录茎环终止结构， 推测为终止子序列。将龙眼的ｒｂｃＬ 基因与烟草、水稻、葡萄、拟南芥菜等多种植物的相应序列进行了植物分子系统学的初步探讨。

The whole Chloroplast rbcL gene from Dimocarpus longan Dongbi cv.has been sequenced by gene cloning and PCR based sequencing.The complete sequence is 1836bp long with a coding sequence of 1428bp,which encode a polypeptide of 475 amino acids and one termination codon.The 5’upstream sequence including putative promoter is 284bp,with a -10 sequence(TACAAT),a -35 sequence(TTGCGC)and the SD sequence(GGAGG).The 124bp long downstream sequence contains three transcription stem loop termination structures which are located in 30-100bp downstream from the termination codon.The similarity of DNA sequence and amino acid sequence of this gene with those of some other plants,such as Nicotiana tobacum,Oryza sativa,Vitis vinifera ,is preliminarily studied.