29nt-RNA适配子与NF-κBP50复合物的分子动力学模拟

目的:研究29nt-RNA适配子与NF-κB P50作用的结构基础,为RNA适配子的结构改造提供理论指导。方法:采用分子动力学、MM_GBSA自由能计算等方法对RNA适配子与NF-κB P50复合物进行动力学模拟以及分解能计算。结果:29nt-RNA适配子的大沟槽为与NF-κB P50结合的关键结构特征。结论:形成更稳定的RNA大沟槽结构,使之易与NF-κB P50结合,可起到更有效的抗肿瘤作用。