兰州肉苁蓉rDNA基因内转录间隔区序列分析

目的首次检测兰州肉苁蓉的rDNA内转录间隔区序列,并利用其序列作为遗传标记分析了5个不同种的肉苁蓉的遗传变异情况。方法采用植物基因组小量抽提试剂盒法作为基因组DNA提取的最佳方法,提取兰州肉苁蓉的核基因组DNA,并且建立了适合兰州肉苁蓉的PCR反应体系,利用合成的特异性PCR引物对所提取的DNA中rDNA内转录间隔区序列进行套式扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳得到电泳图谱,并进行分析、测序。经Clusta 1X软件排序,MEGA3软件统计分析和分支分析,建立系统发育树,并计算各类群间的遗传距离。结果琼脂糖电泳图谱及所测序列显示,兰州肉苁蓉DNA中rDNA内转录间隔区全长为580 bp左右,且种间遗传距离较大。结论兰州肉苁蓉与沙苁蓉遗传距离较近,且遗传距离与地理距离存在相关性。