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家蚕SOCS-2基因的克隆与序列分析

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摘要 SOCS基因是JAK/STAT信号通路的负调节基因。为了了解家蚕SOCS基因(BmSOCS)的遗传变异与进化,通过电子克隆获得了SOCS cDNA基因序列,结果显示家蚕基因组中至少存在4种BmSOCS基因,BmSOCS-2基因存在可变剪接。通过RT-PCR从家蚕中扩增得到1个BmSOCS-2基因(BmSOCS-2A),测序结果表明,该792 bp片段含有完整的ORF,由4个外显子组成,编码263个氨基酸残基,分子量为28.8 ku。结构分析显示,BmSOCS-2A有5个α螺旋结构,存在典型的SH2结构域和SOCS结构域。基因芯片数据分析显示,BmSOCS-2在家蚕雌雄性腺组织中表达量最高。进化分析表明,SOCS以不同种类聚类在一起,表明各种SOCS基因家族在各昆虫物种形成前就已产生。
作者 杨李阳 彭景琨 薛仁宇 曹广力 贡成良
机构地区 苏州大学基础医学与生物科学学院
出处 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第1期14-19,共6页 Jiangsu Agricultural Sciences
基金 国家自然科学基金(编号:31072085) 江苏省自然科学基金(编号:BK2009117) 江苏省"六大人才高峰"项目(编号:2009-D-Ag18) 江苏省苏州市自然科学基金(编号:YJG0907) 苏州大学重大应用研究培育资助项目(编号:Q3134991)
关键词 家蚕 JAK/STAT信号途径 SOCS-2基因 电子克隆 序列分析
分类号 Q78 [生物学—分子生物学]
  • 相关文献

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共引文献13

江苏农业科学
2012年 第1期

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