使用国有农用地是否应进行补偿

豫北某县2009年上报一批乡镇建设用地报件,其中有一宗地属于国有农用地,该县政府只申请办理了农用地转用手续。等农用地转用手续批复后,该县组织对该宗地进行挂牌出让。但有一个问题一直没有解决。该宗国有农用地一直由甲村村民耕种,有15年左右时间。