摘要
KNOX基因家族编码同源异型盒蛋白,在植物生长发育过程中起重要调控作用。利用生物信息学手段在全基因组水平上对大豆(Glycinemax)KNOX家族基因进行鉴定和分类,并分析其基因结构、蛋白同源结构域特征以及基因表达方式。研究结果表明:大豆中的27个GmKNOX基因可以分为GmKNOXI和GmKNOXII两个亚类,其中GmKNOXI类可分为3个主要的进化支,GmKNOXII类分为2个主要的进化支;26个GmKNOX基因不均匀地分布在16条染色体上,GmKNOX27尚无法定位。不同组织表达谱的分析表明:GmKNOXI类基因表达部位比较集中,以茎顶端分生组织中表达量最高;而GmKNOXII类基因的表达特异性较GmKNOXI类低,表达部位更广泛。
KNOX family genes, coding homeobox proteins, play an important role in plant development. We investigated soybean KNOX family genes with genome database analysis and bioinformatics. Phylogenetic analysis characterized 2 classes of GmKNOXgenes： GmKNOXl with 3 sub-classes and GmKNOXll with 2. In total, 26 GmKNOXgenes distribute in 16 chromosomes of soybean, and GmKNOX27 could not be located in any chromosome. Whole-genome expression analysis revealed cass l GmKNOXgenes mainly expressed in meristematic tissues and class ll GmKNOXgenes broadly expressed in different tissues.
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期236-247,共12页
Chinese Bulletin of Botany
基金
国家自然科学基金重大研究计划(No.91131008)
山东省自然科学杰出青年基金(No.JQ200909)
