苹果NAC转录因子家族生物信息学分析

NAC转录因子是植物特有的且具有多种生物功能的一类重要转录因子,该家族转录因子广泛参与植物生长发育以及器官建成、逆境胁迫应答等反应。首先利用生物信息学方法对苹果256条NAC蛋白序列的系统发生和NAC基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级结构和三级结构进行预测和分析,同时还分析了苹果与拟南芥NAC转录因子家族之间的联系。结果显示苹果256条蛋白序列与拟南芥94条NAC蛋白序列一起被分成了23个亚族,拟南芥与苹果NAC基因间具有较高的保守性。基因组定位结果显示苹果256条NAC基因分布在17条染色体上。研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列疏水性存在一定的差异;二级结构预测分析发现,256条氨基酸序列以随机卷曲为主要组成部分,且256条氨基酸序列三维结构相似。本试验结果将为苹果NAC转录因子家族的进一步功能分析提供重要研究基础。