法院判决返还已办转移登记的房屋应如何办理

某市登记机构询问：某银行将一处自有房屋卖给某甲,银行和某甲签订了房屋买卖合同。并办理了转移登记。一年多后,因该房屋质量问题（已由质监部门认定为不合格工程）,某甲向人民法院起诉要求退房。经法院判决,由某甲将房屋返还给银行、银行给与某甲相应的经济补偿。