基因组流行病学（genomicepidemiology）

新一代测序平台的不断出现和生物信息分析技术的飞速发展，将单个细菌全基因组序列测定所需的时间从超过1年缩短到几天，这使得基因组学走人流行病学研究领域，并发挥了重要作用。科学家通过对相关病原菌的DNA序列测定和比较分析，可在疫情暴发早期，推测病原来源和传播路线，了解抗生素抗性、毒力因子携带情况等病原重要特性，为疾病预防控制提供帮助。全基因组研究的高分辨率特性，可被用来追踪确认院内感染途径，以便及时采取必要的处置措施。基因组学分析还可用于回顾性研究，为历史流行病学研究提供数据支持。