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乳腺癌转移相关基因的筛选与生物信息学分析 被引量：5

Identification and Bioinformatic Analyses of Metastasis Related Genes in Breast Cancer
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摘要 乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,转移与复发是乳腺癌患者死亡的主要原因.研究与乳腺癌细胞转移相关的分子靶点对预防乳腺癌术后复发、提高疗效有重要意义.本研究以3组乳腺癌转移相关的基因表达谱数据(GSE2034,GSE2603,GSE12276)为分析材料,采用GeneSpring软件筛选乳腺癌原发瘤与转移瘤芯片数据的差异表达基因,结合生物信息学工具PATHER、STRING、pSTIING和文献挖掘工具iHOP对差异基因及其相互作用关系进行分析.结果显示,共筛选出乳腺癌转移共同差异基因147个,其中表达上调93个,表达下调54个.这些差异基因主要涉及细胞周期与增殖、细胞粘附、细胞迁移、血管形成及信号转导等生物通路和生物过程.差异基因编码蛋白间的相互作用主要集中在14个蛋白,且在更为复杂的网络图谱中仍可见其中9个基因(CXCR4、MMP1、MMP2、MMP3、CTGF、COL1A1、MEF2C、PTGS2及SPARC)在重要的节点位置.文献挖掘发现,COL1A1基因可能为新发现的乳腺癌转移候选基因,为乳腺癌转移的发病机制提供新的思路,也为转移性乳腺癌的分子诊断和个体化治疗奠定基础.
作者 余海浪 夏晓燕 丁大鹏 周珏宇 郑文岭 马文丽
机构地区 南方医科大学基因工程研究所 广州市妇女儿童医疗中心 华南基因组研究中心
出处 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1069-1074,共6页 Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology
基金 广东省医学科研基金(No.B2012203) 广东省领军人才专项基金(No.C1030925)~~
关键词 乳腺癌 转移 基因 生物信息学
分类号 Q5 [生物学—生物化学] Q7 [生物学—分子生物学]
  • 相关文献

参考文献24

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引证文献5

二级引证文献19

中国生物化学与分子生物学报
2012年 第11期

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