摘要
应用生物信息学方法对牛Meg9基因的序列进行预测及分析,发现牛Meg9基因共含有3个外显子,存在3种可变剪切体。与鼠、人和羊序列进行相似性分析,发现牛Meg9基因与绵羊相似性最高,为92%。应用在线软件对牛Meg9基因启动子区及转录因子结合位点进行预测,发现启动子可能位于5′侧翼区1 903~1 953bp处,有16种转录因子结合位点。CpG Island在线软件分析发现牛Meg9基因5′侧翼区和内含子1处共有3个CpG岛。以上研究结果将为研究牛Meg9基因的功能及印记的分子机理奠定基础。
The cattle Meg9 gene is composed of 3 exons and 3 alternative splicings predicted with NCBI,UCSC databases.Sequence homology analysis shows that cattle Meg9 gene shares high identity to sheep(92%).The potential promoter of cattle Meg9 gene is predicted to locate in 1 903~1 953 bp of 5′-flanking region and contained 16 kinds of potential transcription factor binding sites.Three CpG islands are found in 5′-flanking region and intron 1 of cattle Meg9 gene.These results are essential to analyze the biological function and the molecular regulation mechanism of cattle Meg9 gene.
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期91-95,共5页
Journal of Hebei Agricultural University
基金
国家自然科学基金(30972098)
河北省自然基金项目(C2011204001)
转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08009 002)