解开土地增值税清算乱麻

案例 2008年1月，某房地产开发公司（以下简称“A公司”）开始建设“城市花园”项目，规划面积448287平方米，投资42000万元，分五期开发。2011年6月，A公司委托某税务师事务所对其一期工程项目进行土地增值税清算，结果应缴土地增值税为0元，当地税务机关已预征土地增值税106．47万元，A公司据此向主管税务机关申请退税。