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基于布谷鸟搜索的带假结RNA二级结构预测 被引量:1

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摘要 RNA在细胞中具有重要的结构、功能和调节作用。RNA单链的结构对于其在有机系统中的作用具有决定性影响,因此RNA结构预测成为研究热点。假结是一种重要但是难以预测的RNA结构。以热动力学模型与最小自由能量理论为基础,本文提出了一种称为CSRNA的基于布谷鸟搜索的启发式算法,用以预测带假结RNA二级结构。通过基于已知RNA序列的预测实验,本文比较了CSRNA与几种算法的预测结果,证明CSRNA算法的有用性及有效性。
作者 苑寅
出处 《中国新技术新产品》 2013年第1期13-14,共2页 New Technology & New Products of China
  • 相关文献

参考文献2

  • 1D. H. Turner, D. H . Mathews. NNDB: the nearest neighbor parameter database for predicting stability of nucleic acid secondary structure[J]. Nucleic Acids Research, 2009, 38:280-282.
  • 2J. Reeder, P. Steffen, R. Giegerich. PknotsRG: RNA pseudoknot folding including near-optimal structures and sliding windows. Nucleic Acids Research, 2007, 35(2):320-323.

同被引文献9

引证文献1

二级引证文献1

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