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人精子特异性乳酸脱氢酶结构和功能的计算生物学分析

Computational Analysis on Structure and Function of Human Sperm-specific Lactate Dehydrogenase
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摘要 精子特异性乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH),又称乳酸脱氢酶C4(lactate dehydrogenase C4,LDH-C4),特异性地存在于哺乳动物发育成熟的睾丸组织中,与精子的生成、代谢、获能等有密切关系.根据GenBank数据库中人LDH-C4氨基酸序列(P07864),利用PROSITE数据库预测人LDH-C4的功能基序;利用Clustalw2、TreeView1.6.6进行LDH-C4进化树的构建;利用I-TASSER软件预测人LDH-C4的二、三、四级结构以及功能位点.结果表明:在190!196位有1个LDH活性位点,该位点为脊椎动物各亚型乳酸脱氢酶共有的催化位点,为进化中的1个保守序列;从进化树来看,LDHC和LDHB的亲缘关系比较近;人LDH-C4与小鼠LDH-C4的二级、三级结构具有很高的相似性;LDH-C4属乳酸脱氢酶-苹果酸脱氢酶(LDH-MDH)超家族中的LDH-1(cd05293)家族的成员,属于NAD依赖性酶,拥有LDH-1家族具备的基本结构特点.以上结果为研究LDH-C4基因突变对其功能的影响打下基础.
作者 汤莹 颜水堤 郑德柱 张朵 林宇翔 兰风华
机构地区 南京军区福州总医院全军计划生育优生优育研究所
出处 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1088-1096,共9页 Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology
基金 国家自然科学基金(No.81170562) 福建省自然科学基金(No.26111058)~~
关键词 乳酸脱氢酶C4 精子特异性乳酸脱氢酶 计算生物学
分类号 R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
  • 相关文献

参考文献23

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二级参考文献4

共引文献4

中国生物化学与分子生物学报
2013年 第11期

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