蚕豆萎蔫病毒2号(BBWV2)基因组RNA_2的序列测定

以表现顶枯症状的11个辣椒病株的dsRNA为模板,用蚕豆病毒属(Fabavirus)的兼并引物Fab5_R1F和Fab5_R1R进行PCR扩增,其中10个病株扩增到长约400 bp的预期大小的片段,选取其中代表病株XJP1-1的PCR产物进行克隆、测序,得到389 nts的序列片段。基因库检索表明,该片段为蚕豆萎蔫病毒2号(BBWV2)基因组RNA1的片段。说明经PCR检测,具有400 bp片段的10个田间病株均有BBWV2侵染。将基因库中已登陆的BBWV2的RNA2核苷酸序列进行序列比对,然后根据RNA2的序列保守区设计引物R2F-1F和R2F-1R。以病株的总RNA为模板,对分离物XJP1-1进行RNA2组分的克隆、测序,获得1 302 nts的RNA2序列,序列比较显示,该序列与新疆侵染加工番茄的分离物XJ14-1具有最高的序列同源性,为88.9%。