传染性支气管炎病毒S_1基因遗传变异研究

Analysis of Heredity and Aberrance of S_1 Gene of Infectious Bronchitis Virus

本文利用计算机互联网分析了传染性支气管炎病毒 ( IBV) Buead株 (呼吸型 )和 Z株(肾病型 ) S1基因的遗传变异规律。经与 Genbank中 50余个传染性支气管炎病毒的 S1基因序列比较研究表明 :Beaud株和 Z株均存在着高度变异和相对保守区 ,两株病毒 S1基因含有 5～ 6个插入变异区。本文同时分析了两株病毒 S1蛋白氨基酸序列的变异规律 ,研究表明 :各株传染性支气管病毒之间 S1蛋白的氨基酸序列有局部变异 ,其中 1 0 5～ 1 0 6个氨基酸保持恒定不变。功能位点分析表明 :Z株与 Buead株抗原位点的位置和组成已发生变异 ,糖基化位点除 Z株出现两个新位点外 ,其位置没有发生变化 。

The orderliness of the heredity and variation of S 1 gene of infectious bronchitis virus(IBV S 1 gene)was analysed in this article with the sequences of IBV S 1 gene of difference strains in NCBI Genbank.The results show that the varibility of IBV S 1 is higher then other genomous of virus.The certein fragements of IBV S 1 gene are concervative.The rate of the variation of the certain fragments was counted.We may design the primers for PCR depending on it.