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流式细胞术是现代生物学和医学的常用技术，一经发明就被逐渐应用到细胞生物学、免疫学、发育生物学、生理学、植物学、分子生物学等基础研究，医学的临床诊断和治疗，以及农林畜牧养殖、药品检验、食品检验、环境检测等领域。