招投标文件中界定实质性内容的依据和意义

案情简述：A公司某科技采购项目采用公开招标的方式选择供应商，某知名外国公司授权国内一分支机构进行了投标并中标。中标通知书发出后，对方对合同的签订提出了异议，主要是招标文件载明的合同文本中违约金上限比例。