山芝麻三萜类化合物抗UC多靶点作用的分子对接研究

目的通过分子对接,探讨山芝麻中15种三萜化合物对5个溃疡性结肠炎(UC)靶蛋白的作用,从而阐释中药山芝麻抗UC的作用机制与分子基础。方法植物化学成分的二维结构均从PubChem数据库中检索或使用Avogadro程序绘出,并采用Avogadro程序绘出它们的三维结构。从蛋白质数据库(PDB)提取靶蛋白(PPAR-gamma、JAK、TNF-alpha、IKK-beta and IL-2)的X-衍射晶体结构。分子对接研究采用AutoDock Vina软件。结果通过与阳性药物相比较,山芝麻的三萜类化合物与靶蛋白的结合能较高(或相对较高),认为其与UC治疗相关的靶点蛋白有显著的结合亲和力,是它们的有效抑制剂。结论分子对接研究显示山芝麻三萜类化合物对靶蛋白PPAR-gamma、JAK、TNF-alpha、IKK-beta and IL-2有抑制作用,预期其能有效防治溃疡性结肠炎。