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从基于结构定义的序列模体识别蛋白质的超家族 被引量：2

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摘要 以进化上相距较远的蛋白质酪氨酸磷酸酶Ⅰ和Ⅱ为例,通过结构比较和基于结构的序列比对及共同保守区域残基替换模式的分析,定义了基于结构的序列模体.利用这种新的模体对SWISS-PROT和TrEMBL蛋白质序列库进行搜索,可特异性地同时识别磷酸酶Ⅰ和Ⅱ,其识别正确率可达98.4％.而在此之前,尚未见可同时识别磷酸酶Ⅰ和Ⅱ序列模体的报道.
作者 黄京飞 刘次全
机构地区 中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室
出处 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第8期591-595,共5页 Chinese Science Bulletin
基金 国家自然科学基金(批准号:30170507 30024004) 云南省自然科学基金及其主任基金(批准号:1999C0084M 98C007R)资助项目
关键词 基于结构定义 蛋白质酪氨酸磷酸酶 序列模体 超家族 序列识别 假定蛋白质 分子进化
分类号 Q51 [生物学—生物化学]
  • 相关文献

参考文献1

二级参考文献3

共引文献11

同被引文献26

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引证文献2

二级引证文献7

科学通报
2002年 第8期

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