《生态环境学报》的各项学术质量指标都较高

据中国科学技术信息研究所2013年9月发布的《2013版中国期刊引证报告（核心版）》，《生态环境学报》2012年的核心影响因子为1.105（即在1994种中国科技核心期刊中统计的数据）、核心总被引频次为4025次，核心他引率0．93，基金论文比0．90（即90％）。影响因子、被引频次在生态学类（2013年新分出的一类）7种核心期刊中分别列第3和第4位，在全国1994种核心期刊中分别列第101和70位。