广东省猪流行性腹泻病毒ORF3和M基因的克隆与序列分析

为了研究广东省猪流行性腹泻病毒（PEDV）毒株ORF3和M基因的变异情况,试验于2012—2013年从广东省不同地区猪场采集56份腹泻病仔猪的小肠,通过PCR扩增得到8株PEDV的ORF3和M基因,并进行序列比对及遗传分析。结果表明：8株PEDV的ORF3基因与参考毒株核苷酸的同源性为94.7%∽99.9%,其中GD-DG毒株与LZC毒株比较核苷酸的同源性最低（94.7%）,GD-HY毒株与中国TX2011毒株比较核苷酸的同源性最高（99.9%）;8株PEDV的M基因与参考毒株核苷酸的同源性为95.7%∽99.9%,其中GD-MM毒株与泰国M_NIAH380_98毒株比较核苷酸的同源性最低（95.7%）,GD-HZ毒株与韩国CPF299、PFF188、PFF285毒株及泰国KU01CB08毒株比较核苷酸的同源性最高（99.9%）。说明近年来广东省流行的PEDV毒株以变异株为主,与经典株CV777的亲缘关系较远。