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中国MERS输入病例病毒基因组测序及分析

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摘要 为测定分析中国第一例输入性中东呼吸综合征冠状病毒基因组序列.采用PCR分段扩增、测序、拼接的方法,组装病毒基因组序列,应用BLAST,MEGA6.0,SIMPLOT,RDP等软件分析病毒序列的相似性、变异、进化、重组事件.结果发现,所完成的病毒序列长度为29928 bp,与韩国报道的序列最为接近.病毒核苷酸序列与近期中东地区分离到的病毒株序列相似性高达99.53%~99.92%;在多聚蛋白ORF1ab中有3个新发突变,而S,E,M,N蛋白未出现变异;核苷酸序列无明显的片段重组现象.本研究表明,中国广东第一例输入性MERS患者的序列没有出现明显的变异,一些位点突变后功能变化仍需进一步研究.
作者 谢茜 曹宇娟 苏娟 吴娴波 万成松 柯昌文 赵卫 张宝
机构地区 南方医科大学公共卫生与热带医学学院 广东省疾病预防控制中心微生物检验所
出处 《中国科学：生命科学》 CSCD 北大核心 2015年第8期799-803,共5页 Scientia Sinica(Vitae)
基金 NFSC-广东省联合基金(批准号:U1132002) 广东省科技计划项目(批准号:2010A40302003) 国家自然科学基金(批准号:81272483)资助
关键词 基因组 测序 中东呼吸综合征 冠状病毒
分类号 R373.1 [医药卫生—病原生物学]
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参考文献11

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中国科学：生命科学
2015年 第8期

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