期刊文献+

应用二代测序技术研究HIV准种进化的相关进展 被引量:2

Application of Next-generation Sequencing Techniques in the Dynamics of HIV-1 Quasispecies
原文传递
导出
摘要 近十年二代测序技术快速发展,与一代测序技术相比具有通量高、速度快、灵敏度高、准确率高等优点,主要以454焦磷酸测序、Illumina测序、Ion Torrent测序和SOLiD测序为代表。二代测序技术在HIV领域的研究已经越来越广泛,本文介绍了上述四种二代测序技术在HIV准种进化方面的应用。 In the last decade, next-generation sequencing (NGS) technology, which is characterized by be- ing high-throughput, rapid, sensitive, and accurate, has developed rapidly. Main components of NGS are platforms: 454 sequencing; illumina sequencing; ion torrent sequencing~ SOLID sequencing. NGS is used widely for the human immunodeficiency virus (HIV)-I. In this review, we focus on applications of the dy- namics of HIV-1 quasispecies.
作者 张晶 邢辉
出处 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期573-578,共6页 Chinese Journal of Virology
基金 国家自然科学基金(81471962) (81261120393) 广西八桂学者艾滋病防控关键技术岗位专项经费 国家科技重大专项"艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治"(2012ZX10001-002)
关键词 HIV 二代测序 劣势耐药株 超感染 准种 HIV Next-generation sequencing technology Minority variants Superinfection Quasispecies
  • 相关文献

参考文献6

二级参考文献126

  • 1ZHOU XiaoGuang1,REN LuFeng1,LI YunTao2,ZHANG Meng1,YU YuDe2 & YU Jun1 1 Key Laboratory of Genome Sciences and Information,Beijing Institute of Genomics,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100029,China,2 Institute of Semiconductors,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100083,China.Next-generation sequencing technology:A technology review and future perspective[J].Science China(Life Sciences),2010,53(1):44-57. 被引量:29
  • 2陈曦,邢辉,贺健梅,魏民,郑军,马鹏飞,陈裕旭,梁浩,欧秋英,邵一鸣.湖南省HIV-1分子流行病学研究[J].实用预防医学,2005,12(3):483-485. 被引量:7
  • 3梁浩,罗皓,邵一鸣,刘伟,张志勇,邢辉,卢灿健,沈菁,麦志丹.广西HIV-1重组毒株env区快速基因分型方法的建立[J].中华实验和临床病毒学杂志,2006,20(3):282-284. 被引量:4
  • 4李延恩,周艳红.SNP功能分析的生物信息学方法及其资源[J].计算机仿真,2007,24(4):297-300. 被引量:9
  • 5Palmer S,Kearney M,Maldarelli F,et al.Multiple,lined human immunodeficiency virus type 1 drug resistance mutations in treatment-experienced patients are missed by standard genotype analysis[J].J Clin Microbiol,2005,43(1):406-413.
  • 6Coffin JM.HIV population dynamics in vivo:implications for genetic variation,pathogenesis,and therapy[J].Science,1995,267(27):483-489.
  • 7Fischetti L,Danso K,Dompreh A,et al.Vertical transmission of HIV in Ghanaian women diagnosed in cord blood and post-natal samples[J].J Med Virol,2005,77(3):351-359.
  • 8Quan Y,Brenner BG,Dascal A,et al.Highly diversified multiply drug-resistant HIV-1 quasispecies in PBMCs:a case report[J].Retrovirology,2008,30(5):43-48.
  • 9中国疾病预防控制中心.全国艾滋病检测技术规范(2009年修订版)[S].2009.
  • 10Cho YK,Jung Y,Lee JS,et al.Molecular evidence of HIV-1 transmission in 20 Korean individuals with haemophilia:phylogenetic analysis of the vif gene[J].Haemophilia,2012,18 (2):291-299.

共引文献233

同被引文献20

引证文献2

二级引证文献7

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部