摘要
杨梅(Myrica rubra Sieb.et Zucc.)是我国南方著名的特产珍果,为促进杨梅分子育种及功能基因研究,对杨梅进行了全基因组测序。采用Illumina Hiseq 2500双端测序策略,构建了200 bp文库,进行双端125 bp(PE 125)测序,得到约13.70 Gb的原始数据。数据评估得知杨梅基因组大小约为304.38 Mb,重复序列含量约为45.82%,杂合率约为0.58%,基因组的GC含量约37.99%。利用SOAPdenovo软件进行了拼接组装。这一结果有助于开展杨梅后续的分子育种及基因功能研究。
出处
《浙江农业科学》
2015年第10期1564-1566,共3页
Journal of Zhejiang Agricultural Sciences
基金
国家公益性行业(农业)科研专项经费(201203089)
浙江省果品农业新品种选育重大科技专项(2012C12904-3)
浙江省农业科学院杨梅工程中心基金