氨基酸疏水性对蛋白质结构的影响

本文应用计算机模拟方法对蛋白质折叠结构进行分析,研究了在二维的HP模型下,采用Monte-Carlo算法,运用F-P法、K-D法、沃氏法、埃氏法及米氏法,几种常见的对氨基酸残基疏水特性的不同划分方法,从序列的正反两个方向对真实蛋白质折叠结构进行计算机模拟研究。研究结果表明,同一种疏水特性值从序列的正向或是其反方向开始折叠,蛋白质折叠的最小能量构象的能量值相等;各疏水特征参考值求得的最小能量构象及能量值存在差异。