藏山羊粪便总DNA不同提取方法的比较

为了选择更有效的提取藏山羊粪便DNA的方法及探讨不同提取方法对肠道菌群研究的影响,试验采用三种不同的DNA提取方法,即十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、试剂盒提取法、十二烷基磺酸钠(SDS)裂解法,分别对同一份藏山羊粪便总DNA进行提取,通过测定OD260值与OD280值检测其浓度和纯度,再将获得的DNA进行16S rRNA基因扩增电泳比对。结果表明:三种方法均能提取得到藏山羊粪便的总DNA,SDS裂解法和试剂盒提取法提取的DNA纯度较高,CTAB法提取的DNA纯度较低,且SDS裂解法提取的DNA浓度约是CTAB法的3倍、约是试剂盒提取法的1.4倍。不同的DNA提取方法对藏山羊肠道菌群研究有影响,与其他二种方法相比SDS裂解法提取DNA的效率更高,能够得到更多种类的细菌DNA,更适合提取藏山羊粪便中的DNA及有益于对藏山羊肠道菌群的研究。