健康鲁西黄牛消化道和阴道的细菌多样性研究

为了研究健康鲁西黄牛口腔、瘤胃、肠道和阴道的细菌组成及其相似性,分别提取各部位样本细菌的总DNA,特异扩增16Sr DNA的V3～V4高变区,扩增产物进行测序,对测序结果进行Chao1和Shannon Index多样性指数分析、OTUs交叠分析、聚类分析、物种分布波动性分析。结果发现,阴道和肠道的菌群多样性更高且比较相似,而口腔和瘤胃的则相对较低且比较相近;各样本中厚壁菌门、拟杆菌门所占的比例均较高;口腔和阴道的变形菌门较多,瘤胃的纤维杆菌门较多;阴道和肠道厚壁菌门占优势。结果表明：健康鲁西黄牛阴道和肠道细菌相似性很高并且含有相同的优势菌为厚壁菌门。阴道与口腔和瘤胃细菌的相似性很低,口腔、瘤胃和肠道的细菌相似性也很低。