厌氧氨氧化功能微生物PCR-DGGE分析方法优化

基于厌氧氨氧化（anaerobic ammonium oxidation,Anammox）开发的相关工艺在污水脱氮处理中具有重要作用;但Anammox微生物是一类目前尚不能分离和纯培养的微生物,分析其功能微生物的类型,对于研究其生物学机理并改良其工艺具有重要意义。本研究对变性梯度凝胶电泳（denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE）在Anammox微生物应用中的分析条件进行了优化,以提高PCR-DGGE的分析效果。结果表明,采用针对16S r DNA V3区的GC-F341/R518引物组合,PCR最佳退火温度为64℃;DGGE电泳中,最佳上样量为5-7μL,最佳胶浓度为8%,最佳电压/时间为80 V/16 h。优化后的PCR-DGGE具有准确性高和灵敏度好的特点。