大白菜InDels标记开发及其在剩余杂合体鉴定中的应用

大白菜（Brassicarapassp．pekinensis）参考基因组序列的公布及测序成本的降低为大规模开发插入／缺失（Insertion／Deletion，InDel）标记提供了可能。该研究以性状差异明显的大白菜自交系Hel02与06-247为亲本，开展了全基因组重测序、标记开发和验证工作。二者测序深度分别为10×和8X，经筛选共获得330218个InDels差异位点，出现频率为1．2个／kb，其中有ll238个差异位点位于编码区，包括5184个差异基因，每个基因平均包含2．2个差异位点。