北京鸭BNIP3L基因CDS区克隆及序列分析

BNIP3L定位于线粒体，广泛分布于各个组织中，具有促凋亡的作用。根据NCBI上鸭BNIP3L基因预测序列设计引物，利用PCR技术，对鸭BNIP3L基因CDS区序列进行克隆。结果表明：扩增出BNIP3L基因的CDS区序列全长为543bp，编码180个氨基酸，相对分子质量为19．52ku，理论等电点为6．334。另外，该氨基酸序列存在典型的3个低密度区域和1个跨膜结构域。经比对分析发现鸭的BNIP3L基因具有特有的保守序列，而且与鸟类的BNIP3L基因具有较高的相似性，并对其氨基酸序列和蛋白质结构进行了分析，整个多肽链中疏水性氨基酸为151个，亲水性氨基酸为29个，因此整个多肽链应为疏水性。其蛋白质二级结构由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成，分别占22．78％、7．22％、17．78％和52．22％。以上数据表明北京鸭 BNIP3L基因CDS区序列与安氏蜂鸟、朱鹩、鸡具有较高的一致性，且在物种进化过程中较为保守。