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DNA条形码专用R包及其主要功能简介 被引量:2

Main functions and descriptions of R packages used for DNA barcoding
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摘要 S_(PIDER)和BarcodingR软件包作为DNA条形码研究的专用R软件包,整合了基于DNA条形码的物种识别算法和数据分析策略,避免了各种非商业用途软件的局限性,为DNA条形码的研究提供了便捷性和可操作性。本文对SPIDER和BarcodingR软件包的主要功能进行整体介绍,并以西藏夜蛾科COI、松毛虫属ITS等数据为例,进行主要函数的演示分析,希望为昆虫DNA条码的应用分析提供帮助。 S_(PIDER_ and BarcodingR,are new R packages implementing a number of useful functions for DNA barcoding analyses and associated research into species speciation. Both of them avoid limitations of noncommercial computer programs and provide convenience and operability for user. Here we demonstrated the main functions of the two packages with Tibet moth,pine moth datasets.
出处 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期485-492,共8页 Journal of Environmental Entomology
基金 国家自然科学基金青年科学基金项目(31601877)
关键词 DNA条形码 R语言 SPIDER BarcodingR DNA barcoding R language SPIDER BarcodingR
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