沙地云杉、沙冬青和山杏ISSR-PCR反应体系优化及种间多态性比较

利用ISSR分子标记技术对沙冬青、沙地云杉、克旗山杏和凉城山杏的PCR反应体系进行了优化,分别建立了适合沙地云杉、沙冬青、克旗山杏和凉城山杏的ISSR标记扩增体系;利用筛选出的11个扩增条带清晰且多态性高的引物对沙地云杉、沙冬青、克旗山杏和凉城山杏进行遗传多样性研究。其中得到清晰谱带187条,多态性谱带184条,多态位点百分率(PPB)为98.40%。应用POPGENE32分析表明:观察等位基因数(N_a)为1.984 0,有效等位基因数(N_e)为1.678 1,Nei’s基因多样度(H_e)为0.396 4,Shannon多态性信息指数(Ⅰ)为0.582 0。采用UPGAM法聚类分析表明:沙地云杉、沙冬青、克旗山杏和凉城山杏可分为3类,克旗山杏和凉城山杏为Ⅰ类,沙地云杉为Ⅱ类,沙冬青为Ⅲ类。聚类分析结果显示,除了山杏物种之间的亲缘性之外,沙冬青与山杏的亲缘关系较远,相似性较低;沙地云杉与山杏2个不同物种却有一定的相似性。