有抵押权负担的房屋可以办理遗赠转移登记

根据《继承法》第25条和《物权法》第29条等相关法律法规的规定,如受遗赠人在法定时限内作出接受遗赠的表示的,其即合法取得物权,而抵押权也不受继承的影响。申请登记只是履行登记程序,登记机构无权拒绝,且不会对抵押权人产生侵害,因此应当依法受理并办理单方申请的转移登记。