金川牦牛TGF-β1基因克隆及蛋白质结构分析

为了探讨金川牦牛天然免疫调节因子TGF-β1基因特点,试验根据Gen Bank公布的野牦牛序列设计引物,并运用Ex PASy、ABCpred、BIMAS等生物信息学软件对基因序列进行核酸和蛋白质结构分析。结果表明：克隆的金川牦牛TGF-β1基因片段长度为607 bp,开放阅读框为471 bp,可编码157个氨基酸,其中丙氨酸、脯氨酸的含量最多,分别达14.01%、12.10%。分子质量为16.324 87 ku,理论等电点为9.48,不稳定系数为63.90。二级结构以无规则卷曲为主（64.33%）。TGF-β1基因存在潜在的抗原表位,B细胞有77-92,99-114,121-136等17个表位区域,T淋巴细胞有2-10,19-27,68-76,126-134等20个表位区域。系统进化分析中,金川牦牛TGF-β1基因与野牦牛同源性为96.7%,亲缘关系最近。试验获得金川牦牛TGF-β1基因,在哺乳动物中具有较高的保守性。