猪圆环病毒2型河北株全基因组序列分析

为了解秦皇岛及周边地区猪圆环病毒2型（PCV-2）分子流行病学变化特点,试验从20个疑似患猪圆环病毒病的猪场采集肺脏、脾脏、淋巴结、扁桃体样本24份,采用PCR方法检测样品中PCV-2感染情况,对4株PCV-2河北流行株的全基因组进行扩增、克隆和测序,并将全基因组序列与国内外主要流行毒株进行同源性比对及构建系统进化树。结果表明：在24份样品中,有20份样品为PCV-2阳性,阳性率达到83.33%,其中4株PCV-2河北流行株全基因组序列全长均为1 767 bp;经序列比对与进化树分析发现,均与当前流行的PCV-2b型毒株聚为一支,同源性为95.9%-99.9%。说明PCV-2b型为秦皇岛及周边地区的主要流行毒株。