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安徽省克氏原螯虾白斑综合征病毒缺失区序列分析

Sequence Analysis of Deletion Regions of White Spot Syndrome Virus from Procambarus clarkii in Anhui Province
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摘要 为了解安徽省克氏原螯虾(Procambarus clarkii)白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)缺失区ORF23/24和ORF14/15的遗传差异及其与世界各地WSSV的遗传进化关系,2016年4月—8月,在安徽省6个市采集了9个养殖克氏原螯虾样本进行WSSV套式PCR检测,扩增病毒缺失区ORF23/24和ORF14/15,将获得的序列进行比较分析。结果显示,9个样本均在第1轮PCR扩增中获得阳性结果,其ORF23/24区与中国台湾株(TW)比对,缺失5 892 bp或9 310 bp,其ORF14/15区与WSSV祖先株(TH-96-Ⅱ)比对,缺失5138 bp或5948 bp。其中8个样本中WSSV与2008至2010年在江苏的克氏原螯虾中检测到的一些毒株的ORF23/24和ORF14/15区缺失情况相同,且这些病毒ORF14/15区均缺失5 138 bp,与TW株缺失情况相同。
出处 《水产科技情报》 2018年第4期206-210,共5页 Fisheries Science & Technology Information
基金 安徽省科技厅重点研究和开发计划项目(1804a07020116) 安徽省农科院学科建设项目(16A0516) 安徽省农科院科技创新团队(14C0504)
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参考文献8

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  • 1样晓玲,宋晓玲.杆状病毒性的皮下及造血组织坏死:对虾暴发性流行病的病原和病理学[J].海洋水产研究,1995,16(1):1-10. 被引量:103
  • 2蔡生力,黄,王崇明,宋晓玲,孙修涛,于佳,张岩,杨丛海.1993─1994年对虾暴发病的流行病学研究[J].水产学报,1995,19(2):112-119. 被引量:91
  • 3Marks H, van Duijse J J, Zuidema D, et al. Fitness and virulence of an ancestral white spot syndrome virus isolate from shrimp[J]. Virus Res, 2005,110( 1-2): 9-20.
  • 4Dieu B T, Marks H, Sicbcnga J J, et al. Molecular vpidemiology of white spot syndrome virus within Vietnam[J]. J Gen Virol, 2004, 85(12): 3607-3618.
  • 5Marks H, Goldbach R W, Vlak J M, et al. Genetic variation among isolates of white spot syndrome virus [J]. Arch Virol, 2004, 149(4): 673-697.
  • 6Pradeep B, Shekar M, Karunasagar I, et al. Characterization of variable genomic regions of Indian white spot syndrome virus [J]. Virology, 2008, 376(1): 24-30.
  • 7Kono T, Savan R, Sakai M, et al. Detection of white spot syndrome virus in shrimp by loop-mediated isothermal amplification [J]. J Virol Methods, 2004,115(1): 59-65.
  • 8Macda M, Kasomchandra J, Itami T, et al. Effect of various treatments on white spot syndrome virus(WSSV) from Penaeus japonicus(Japan) and P. monodon(Thailand)[J]. Fish Pathol, 1998, 33(4): 381-387.
  • 9Benson G. 1999. Tandem repeats finder:a program to analyze DNA sequences. Nucleic Acids lies, 27: 573- 580.
  • 10Dieu B T, Marks It, Siebenga J J, et al. 2004. Molecular epidemiology of white spot syndrome virus within Vietnam. J Gen Virol, 85: 3607-3618.

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