2株PEDV贵州分离株M基因的克隆及相似性分析

为了解贵州省猪流行性腹泻病毒（PEDV）分离株M基因的变异及分子进化情况,试验采用RT-PCR扩增、目的基因克隆与测序及生物信息学软件对贵州省分离的PEDV-GZAS株和PEDVGZHZ株M基因进行序列分析。结果表明：经RT-PCR扩增,得到的片段大小为695 bp;测序结果证实,贵州分离株M基因核苷酸序列大小为695 bp;贵州分离株PEDV-GZAS株与PEDV-GZHZ株之间同源性为84.2%;PEDV-GZHZ株与瑞士疫苗株（AF353511）之间的同源性为97.7%,与中国贵州（KF150217）、泰国（FJ158546）和美国（KF272920）分离株同源性最高为99.4%;贵州分离株PEDVGZAS株与瑞士疫苗株（AF353511）之间的同源性为97.5%,与中国贵州（KF150217）、泰国（FJ158546）和美国（KF272920）分离株同源性最高为99.3%;此次分离的2株分离株都与中国河南（EU287429）分离株同源性最低为83.1%。PEDV贵州分离株PEDV-GZAS株M基因与泰国（FJ158546）分离株遗传进化关系最近,与中国河北（JF508465）分离株亲缘关系较近;PEDV-GZHZ株与PEDV-GZAS株及参考毒株之间遗传进化关系较远。