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用支持向量机算法预测六类酶的亚类
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摘要
从蛋白质序列出发,我们首先将每条蛋白质序列分成等长的15段得到离散增量值、低频功率谱密度值、N端和C端的矩阵打分值和模体频数构成的组合向量表示相应的序列信息,用支持向量机算法,对六类酶家族类的亚类分别进行分类预测。预测的总精度依次为92.4%,92.9%,95.0%,97.3%,95.6%和97.9%。除转移酶和水解酶略低于前人,其余好于前人的预测结果。
作者
王莹
机构地区
齐齐哈尔工程学院
出处
《才智》
2013年第27期255-256,共2页
Ability and Wisdom
关键词
模体
矩阵打分值
离散增量
随即森林
酶的亚类
分类号
Q55 [生物学—生物化学]
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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