云南部分地区猪流行性腹泻病毒S基因克隆与序列分析

为了解云南省不同地区猪流行性腹泻病毒(Porcine Epidemic Diarrhea Virus,PEDV)S基因的核苷酸序列和氨基酸序列与疫苗毒株和早期分离株S基因的差异性,本实验分别从云南安宁、宣威、昆明、师宗、陆良、富民、临沧、曲靖8个地区采集疑似感染PEDV仔猪的小肠及粪便样品46份,采用RT-PCR方法进行PEDV S基因的扩增、测序分析。结果显示:云南安宁、宣威、临沧、富民的PEDV阳性率分别为83.33%、57.14%、100%、62.50%,46份样品中有21份样品为PEDV阳性,阳性检出率高达45.65%;将云南安宁、宣威、临沧、富民检测到的PEDV的S基因的核苷酸序列及推导的氨基酸序列与PEDV标准株CV777、韩国DR13株及其致弱株、国内早期的甘肃株、上海株、2010年至2012年的各地分离株进行比较分析,发现这次从云南检测到的PEDV毒株均为同一株毒株,此毒株与浙江株、黑龙江株、河南株、广东株、北京株、湖北株和福建株相似,与疫苗毒株和早期分离株的S基因相比发生了明显的变化。