屋尘螨变应原第2组分序列多态性分析

目的运用生物信息学方法分析屋尘螨变应原第2组分进行氨基酸序列构成特点。方法使用NCBI数据库(美国国立生物技术信息中心,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)蛋白质数据库下载屋尘螨变应原第2组分各亚型的氨基酸序列。分别使用CLUSTALX 2.1、MAGA7进行序列比对和进化树构建。结果获得Der p 2氨基酸序列共13个亚型,对Der p 2氨基酸序列进行对比,有9处氨基酸序列发生变化,构建系统进化树显示进化树中Der p 2亚型聚类成4簇。结论 der p 2氨基酸序列具有多态性,为进一步研究奠定基础。