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一种改进的基因功能网络术语相似度计算方法

An Improved Similarity Calculation Method of Terminology of Gene Function Network
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摘要 阐述现有基因术语间语义相似度计算方法,提出基于融合高斯核函数的重启随机游走的基因本体术语相似度算法(Random Walk with Restart-based Similarity Measure, RWRSM),测试算法性能并进行分析,结果表明该算法优于其他算法,可以提高准确性及稳定性。 The paper elaborates on the existing semantic similarity calculation methods between Gene Ontology( GO) terminologies,puts forward the Random Walk with Restart-based Similarity Measure(RWRSM) based on the Gauss Kernel Function, tests the performance of the calculation method and carries out analysis. The result shows that the calculation method is superior to any other calculation method since it increases the accuracy and stability.
作者 唐智 刘志明 罗凌云 欧阳纯萍 万亚平 TANG Zhi;LIU Zhiming;LUO Lingyun;OUYANG Chunping;WANG Yaping(School of Computer University of South China, Hengyang 421001,China)
出处 《医学信息学杂志》 CAS 2019年第2期47-52,共6页 Journal of Medical Informatics
基金 国家自然科学基金"大型复杂医学领域本体质量评估理论研究"(项目编号:61502221) 国家自然科学基金"面向资源型社交网站的知识图谱构建方法研究"(项目编号:61402220) 南华大学研究生科学基金项目"基于基因本体相似度计算算法研究"(项目编号:2018KY Y083) 湖南省哲学社会科学基金"面向新闻评论的网络舆情演化分析研究"(项目编号:16YBA323)
关键词 基因功能网络 术语相似度 NETSIM2 随机游走 基因本体 gene function network term similarity NETSIM2 random walk Gene Ontology(GO)
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参考文献2

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